Das Referat Gesunde Ernährung entwickelt vielfältige multimediale Publikationen und Veranstaltungen zur Stärkung einer gesundheitsförderlichen und nachhaltigen Ernährung in Deutschland. Darüber hinaus steht das Referat für Fachinterviews zur Verfügung.
Hier wird die Ernährungspyramide fachlich betreut, die die Umsetzung der Ernährungsempfehlungen im Alltag erleichtert. Auch die Konzeption und Durchführung des BZfE-Forums und die Erstellung des Newsletters für Ernährungsfachkreise sind Aufgaben.

Zusätzlich unterstützt das Referat das Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL) bei dessen Initiativen. So ist hier die Koordinierungsstelle Ernährungsstrategie angesiedelt, die unter anderem bei der Umsetzung des Deutschen Ernährungstags und der Kommunikation rund um die Ernährungsstrategie fachlich berät.